病原诊断中的精准医疗

年1月底,美国总统奥巴马在年国情咨文演讲中宣布了一个生命科学领域新项目——精准医疗计划,致力于治愈癌症和糖尿病等疾病,目的是让所有患者取得最公道的医治。中国精准医疗的提出是在年4月21日的“清华精准医学论坛”上,是中国目前大力推出的医疗方式。什么是精准医疗?精准医疗(precisionmedicine)是以个性化医疗为基础、随着基因组测序技术快速进步和生物信息与大数据科学的交叉运用而发展起来的新型医学概念与医疗模式。它的本质是通过基因组、蛋白质组等医学前沿技术,对大样本人群与特定疾病类型进行生物标记物的分析与鉴定、验证与运用,从而精确寻觅到疾病的缘由和医治的靶点,并对一种疾病不同状态和进程进行精确分类,终究实现对疾病和特定患者进行个性化精准医治的目的,提高疾病诊治与预防的效益。借用奥巴马的形象比喻来解释:“每位患者的病情都是独一无二的,医生们一直都在极尽所能去因人用药。就像你要输血,血型一定要匹配,这是一个非常重要的发现”,“我们将我们的遗传密码与癌症进行‘配型’,并成为切实可行的标准,我们决定药物的剂量,将犹如丈量我们的体温一样方便——这就是精准医学给我们带来的希望”。广义而言,精准医疗是一种基于患者定制的医疗模式,在这类模式下,医疗的决策、实行等都是针对每一名患者个性化而制定的疾病诊断和医治。上述精准医疗的概念提示,精准医治来自于精准的诊断,特别是感染性疾病。微生物实验室在精准医疗中的价值可想而知。年卫生部制定了历史上最严厉的抗生素管理文件,其终究目的也是要精准公道的运用抗生素。下面从4个方面讨论微生物实验室如何在精准医疗中体现自己的价值。1快速找到病原是实现精准医疗的关键找到病原是精准医疗的开始和关键,由于不同的病原医治的方案不同。微生物室采取快速的初始诊断系统,尽早肯定病原的类或种,可以大大减缓病情,挽救生命。如用涂片革兰染色检测感染部位的细菌,可以明确告知临床是阳性菌或阴性菌感染、降钙素原(Procalcitonin,PCT)实验阳性提示细菌性感染,G实验阳性提示侵袭性真菌感染,如果隐球菌荚膜抗原阳性提示隐球菌感染。临床医生结合患者感染部位和病情采取抗细菌或抗真菌或抗隐球菌的医治方案,而这些医治方案在感染疾病医治的指南中是有非常明确的提示的。微生物实验室也可用自动化装备使鉴定速度(在取得纯菌落后)减少到2~3h,乃至是几分钟。2正确的药物敏感性报告是精准医治的根据在感染诊疗进程中经验用药依赖于细菌耐药监测的资料,但监测资料反应的是某种细菌的一般耐药规律而不是个性化的规律,而特定患者的药物敏感性报告提供了靶向医治的根据,这是实现精准医治的重要步骤。所以微生物实验室快速药物敏感性报告是帮助医生缩短经验医治时间尽快由经验医治转入精准靶向医治的重要措施。正确的药物敏感性报告来自于规范的药物敏感性实验操作,规范的药物敏感性实验操作包括正确选择致病菌,不同细菌应选择公道的实验药物,选择恰当的药物敏感性实验方法〔最低抑菌浓度(minimuminhibitoryconcentration,MIC)或KB纸片散布〕,严谨的药物敏感性报告和药物敏感性报告的审核制度。药物敏感性报告有不可克服的局限性,所以正确的药物敏感性报告必须经过严谨的审核。已具有自动化装备的实验室充分利用审核药物敏感性结果的高级专家软件(如VITEK2Compact)及纵览报告的必须步骤,发出临床信得过的药物敏感性报告。3从细菌耐药机制分析医治失败的缘由是精准医治所必须的常规的医治指南不一定能治愈每一名患者,这也是精准医疗的目的而至。细菌天然耐药机制是不会改变的,而获得性耐药机制是可变的,是不可预测的,这也是实行精准医疗的缘由。获得性耐药机制是致使医治失败的重要缘由,不同患者分离出的相同菌种其耐药性可以完全不同。金黄色葡萄球菌、大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌、阴沟肠杆菌、鲍曼不动杆菌和嗜麦芽窄食单孢菌等临床常见的分离菌,常见的耐药机制是靶位突变、产生超广谱?-内酰胺酶(extendedspectrumbetalactamase,ESBLs)、高产头孢菌素酶(AmpC)、产生碳青霉烯酶或金属酶致使多重耐药、超耐药和泛耐药,但不是每位患者分离出的菌株都会产生耐药机制,也不是都不产生。临床医治需要采取分层诊断和分层医治的手段,特别在经验医治阶段没有细菌学的资料证实该感染细菌是不是已产生了耐药机制,医生只是根据病情采取不同的医治方案,如何掌控“尺寸”,非常重要,尺寸宽了会造成过度医治,掌控太严,会延误医治。实行精准医治需要微生物实验室快速鉴定病原菌、快速的肯定细菌的耐药机制。如采取chromID系列培养基几近覆盖了上述全部耐药机制的测定,而且24h可以获得结果。现代先进的诊断系列,VITEKMS、FilmArray、等份子技术不但使鉴定速度成百成千倍的提高,同时可以测定重要的耐药机制如甲氧西林耐药的金黄色葡萄球菌、万古霉素耐药的肠球菌、产碳青霉烯酶的肠杆菌,实验室技术的发展为精准医治搭建了极好的平台。4主动积极与临床沟通是精准医疗的最高境界新感染情势的特点是低免疫人群的大幅度增加,病原种类增多,致病、条件致病和非致病很难辨别,有效医治时间短,死亡率高。细菌获得性耐药机制多变而不可预测,这是临床医生专业外的专业,而微生物实验室可以成为医生的好帮手。这需要实验室的老师学会主动的、积极的与临床沟通。记忆犹新的8个新生儿病毒性腹泻,按细菌性腹泻医治造成的死亡案例;有隐球菌或烟曲霉菌脑膜炎按结核性脑膜炎医治致使死亡的案例;如果实验室能主动提示临床医生,死亡事件是可以避免的。微生物实验室的工作人员要不断提高本身的专业能力、把实验室的数据转变为临床有价值的信息,及时传输到临床,使医生的医治到达精准,这是患者的欲望、医生的欲望、也是我们每个微生物检验人员的欲望!









































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